如何看懂疾病基因檢測報告?

12.08.2023

如何看懂疾病基因檢測報告?

如何看懂疾病基因檢測報告?

一般來說,疾病基因檢測報告的主體內容包含:

● 基本信息:受檢人的個人信息和送檢信息,包括姓名、年齡、性別、門診/住院號、簡要病史、送檢科室、送檢醫師、檢測項目、送檢時間、樣本類型、樣本編號等。

● 檢測結果:陽性結果會列出檢測到的基因變異相關信息,陰性結果即為未檢測到。

● 結果說明:對檢測到的基因變異的說明和致病性評級。

● 分析意見:實驗室針對檢測結果給出的初步結論和建議。

● 疾病信息:對於檢出疾病臨床特徵的簡要描述。

拿到疾病基因檢測報告時,該怎麼看?

Step 1 先觀察報告中最核心的內容,即:

a. 基因:哪個基因發生變異。

b. 合子類型:有性生殖生物的雌雄胚子結合後形成新的細胞統稱為合子。根據兩性配子的基因型和基因位置的相同與否,合子可分為:

• 純合:即兩個等位基因相同位置存在相同變異。

• 複合雜合:即兩個等位基因都發生變異,但變異位置不同。

• 雜合:即兩個等位基因只有一個發生變異。

• 半合子:屬於一種特殊情況,如男性的X染色體是沒有等位基因的,當男性X染色體基因發生改變稱為半合子變異。

• 野生型:無基因變異。

c. 疾病名稱:檢測到的基因所對應的臨床疾病。

需注意的是,一個基因通常會對應幾種疾病,而一種疾病也會關聯不同基因

d. 致病性:根據《ACMG遺傳變異分類標準與指南》,變異可劃分為5個等級,分別為致病(Pathogenic)、可能致病(Likely Pathogenic)、意義未明(Uncertain)、可能良性(Likely Benign)和良性(Benign)。

一般來說,結果為Pathogenic或Likely Pathogenic,代表致病的可能性比較大;而Uncertain,則代表,目前來看致病性證據不足,但是不能排除,需要根據臨床進一步核實;而Likely Benign或Benign的位點一般不會放到報告中。

Step 2 留意報告中其他重要內容

a. 染色體位置:即變異在染色體的位置,如chr19:39214722,即變異位置在第19號染色體的第39214722位鹼基。

b. 轉錄本:轉錄本是由一條基因通過轉錄形成的一種或多種可供編碼蛋白質的成熟的mRNA。由於不痛轉錄本中對同一個位點的描述(包括核苷酸、氨基酸的位置)是不同的,因此報告中會標註出核苷酸、氨基酸位置對應的是具體哪個轉錄本,方便變異位點的查找即核對。

c. 核苷酸改變/氨基酸改變:根據HGVS規則命名的核苷酸變化/氨基酸變化。核苷酸有A、T、C、G四種且有固定的排列順序,如果第211號位置發生改變,即原本的A被C取代,便會寫作:c.211A>C。此外,相應的氨基酸有20種,也有固定的排列,如果第78號位置絲氨酸(S)被酪氨酸(Y)取代了,可以寫作:p.S78Y。

d. 頻率:指該位點在正常人數據庫中的頻率,通常攜帶的頻率越高,致病的可能性就越小。

e. 遺傳方式:常見的是常染色顯性遺傳(AD)、常染色體隱性遺傳(AR)、X連鎖顯性遺傳(XLD)和X連鎖隱性遺傳(XLR)等。

最後,香港基因化驗表示,不同基因檢測中心所提供的報告可能會略有不同,因此上述內容僅供參考。此外,無論報告是陽性結果還是陰性結果,均不能完全確認/排除被檢者100%患(或不患)病,因此,拿到報告後應儘快到醫生處複診,並請臨床醫生進行綜合的診斷。

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