接種疫苗的目的是刺激接種者獲得抵抗某一特定或與疫苗相似病原的免疫力，藉由免疫系統對外來物辨認，進行抗體的篩選和製造，以產生對抗該病原或相似病原的抗體，進行讓接種這對該疾病具有較強的抵抗能力。
前面提到疫苗是藥品，那麼接種後接種者就有可能會出現不良反應，根據不良反應的原因進行分類，大致可分為以下五種：
① 疫苗製品相關的反應：疫苗本身成分導致不良反應的發生；
② 疫苗質量缺陷相關的反應：疫苗產品質量缺陷導致不良反應的發生；
③ 免疫接種錯誤相關反應：疫苗管理出現問題導致不良反應的發生；
④ 免疫接種焦慮相關反應：對疫苗接種產生焦慮導致不良反應的發生；
⑤ 偶合症：與上述原因均為無關係的因素導致不良反應的發生，多出現在嬰幼兒時期，一些先天性或早期神經系統疾病也會在這個時候出現癥狀。所以這個年齡段兒童接種疫苗時出現偶合症是不可避免的。
從上述分類可看出，與疫苗相關的不良反應只有①和②，這兩種稱為疫苗不良反應，而根據疫苗不良反應的嚴重程度又可分成輕度反應和重度反應：
輕度反應(Minor reaction)：一般發生在接種後數小時，可能會出現局部反應如接種部位發紅、腫脹或疼痛；也有可能是全身反應，如發熱、不適、肌肉酸痛等。
重度反應(Severe reaction)：造成組織器官、功能損害，甚至致殘的可能。雖然嚴重疫苗反應可能會致命，但治療後很少會有任何長期影響。驚厥、過敏樣反應、血小板減少、低反應性張力減退（HHE）等都屬於重度反應。