很多人都擔心親子鑒定結果不準確，但這隻限於那些沒有資質的親子鑒定機構，大多正規的親子鑒定機構其鑒定結果都是值得信賴的。儘管如此，仍有很多因素會影響親子鑒定的結果，包括：
· 採集的樣本：常規樣本往往會比特殊樣本所提取的DNA更加完整，不過部分常規樣本仍有可能會因為某些因素而影響結果。如血液，若被檢者近期輸過血或做過骨髓移植手術，你的血液樣本會因為上述情況而含有供者的DNA信息，而影響鑒定結果。
· 樣本的保存：不同樣本都有着不同時效性，如果錯過鑒定時間，就會導致鑒定結果不準確。
· 鑒定機構的選擇： 選擇親子鑒定機構時，盡量選擇業內有知名度的鑒定機構。通常，親子鑒定機構的案例越多，經驗就越豐富，程序也就越規範，結果自然也會比較準確。
最後，關於「多久可以知道親子鑒定結果」的問題，這主要取決於親子鑒定機構的實力。以香港時代醫療為例，以往大多親子機構都需要將親子鑒定的DNA樣本送往美國進行基因測試，所需時效約15個工作天。隨着時代醫療集團研發團隊的突破，只需懷孕7周便可進行親子鑒定測試，而報告時間也大大縮短至8個工作日，大大降低等待樣本結果的漫長過程，同時還保證送檢樣本的質量和樣本報告的準確。