親子鑒定一般分為兩大類：具有法律效力和不具有法律效力。
具有法律效力，即我們日常所說的司法親子鑒定，一般用於司法訴訟、給孩子落戶口，以及出國移民使用。這種鑒定需要被鑒定人提供身份證明文件，被鑒定人雙方需要到鑒定所採集樣本，拍照留指紋等，因此費用會比個人鑒定。
至於不具有法律效力，即個人親子鑒定，就是對親子關係產生懷疑時，悄悄進行親子鑒定。這種鑒定一般不需要提供身份信息，只需要提供被鑒定人的檢材即可。因此該親子鑒定並不具有法律效力，不能用於打官司、上戶口、出國移民等這些法律途徑。
由於市面上大多親子鑒定機構都不具有法律效力，市場上也沒有一套完善的規則管理，因此不同機構的親子鑒定費用也大有不同，這主要受到以下因素影響：
1.檢材數量：這是很多親子鑒定機構的收費方式，按照檢材的數量多少進行收費。一般追加一個人做親子鑒定，機構都會多收一份檢材費用。
2.按照樣本難度：樣本分為常規樣本和特殊樣本。常規樣本包括血液、血痕、帶毛囊的毛髮、口腔拭子、煙頭等；其他如：指甲、嚼過的口香糖、精液等都屬於特殊樣本。特殊樣本往往會比常規樣本收費貴。
3.按照出結果時間：部分機構會提供加急服務，這種服務往往都需要額外收費。