根據生物遺傳規律所得，一個人有23對(46條)染色體，同一對染色體同一位置上的一對基因稱為等位基因，一般一個來自父親，一個來自母親。如果檢測到某個DNA位點的等位基因，一個與母親相同，另一個就應與父親相同，否則就存在疑問了。

傳統的胎兒親子鑒定以羊水穿刺、絨毛穿刺等技術為主，雖然準確率很高，但是存在一定的流產或胎兒致殘風險。此外，在抽取樣本過程中，也可能給孕媽媽帶來不適或心理壓力。

而香港親子鑒定則是通過抽取少量孕媽媽的靜脈血並提取血液中的胎兒遊離DNA，然後與懷疑父親的DNA進行基因測試，來判斷二人是否具有親子關係。

一般來說，利用DNA進行親子鑒定，只要作十幾個至幾十個DNA位點作檢測，如果全部一樣，就可以確定親子關係;如果有3個或以上位點不同，則可排除親子關係;有1-2個位點不同，需考慮基因突變的可能，加做一些位點的檢測進行辨別。因此，在香港做親子鑒定的準確率相當高，可達到99.9%以上。

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