雖然自然免疫提供的保護性，如勤洗手、改善衛生條件，以及堅持母乳餵養都是保護寶寶的重要條件，但這些措施都不足以預防輪狀病毒感染。
因此，口服輪狀病毒疫苗是預防輪狀病毒感染的推薦手段。
輪狀病毒目前發現的有7個組（群），以英文字母A-G作為編號。其中A組（群）是5歲以下兒童腹瀉的常見病原，可引起90%的輪狀病毒感染性腹瀉。而在A組（群）中，根據抗原的不同又可分為14種不同的G血清型和19種P血清型。
全球流行較廣的是G1，G2，G3，G4型，我國流行較多的G1，G2，G3，G4，G9型，占我國5歲以下兒童輪狀病毒血清型比例98.6%。
目前預防輪狀病毒的疫苗主要有三種，分別是：
進口疫苗：默克公司的五價RotaTeq輪狀疫苗（RV5）
包含多種不同血清型號，覆蓋98%國內常見型號。根據大型研究顯示，能減低因輪狀病毒的入院及急症個案，效用高達100%
推薦接種時間：
寶寶出生後12周或之前服用第1劑疫苗，22周前完成第2劑口服疫苗，32周前完成第3劑口服疫苗，且每劑疫苗最少相隔4周。
進口疫苗：葛蘭素史克公司的Rotarix輪狀疫苗
模擬自然感染，生產自人類輪狀病毒，以模擬自然感染，提供有效的保護。研究證實有效對抗9種輪狀病毒類型感染
推薦接種時間：
寶寶出生後20周或之前服用第1劑疫苗，24周前完成第2劑口服疫苗，且兩劑疫苗最少相隔4周。
國產疫苗：羅特威輪狀病毒疫苗
可預防 A 組 G10P[12] 型輪狀病毒。
推薦接種時間：
從孩子 2 月齡起開始服用，建議 3 歲內每年口服一次。