目前尚無治療輪狀病毒性腹瀉的特效藥物，所以接種輪狀病毒活疫苗是預防的唯一有效手段。輪狀病毒疫苗是減毒重組的活性疫苗，能有效抵抗輪狀病毒對人體的侵襲，即使小朋友感染輪狀病毒，病毒引起的癥狀也會比沒有接種輪狀病毒疫苗的小朋友，減少98%的嚴重感染病例。 香港時代醫療提醒，如果寶寶感染輪狀病毒，建議採用對症治療，如：腹瀉癥狀輕的孩子可用口服補液方法減輕病情，口服補液鹽的配方為氯化鈉3.5克，碳酸氫鈉2.5克，氫化鉀1.5克，葡萄糖20克加水1000毫升，讓孩子當水喝；癥狀較重的孩子，可用靜脈輸液方法預防或減輕脫水和酸中毒癥狀，同時配以潘生丁口服。此外，新生兒感染輪狀病毒，應繼續喂母乳，母乳中含有90%左右的輪狀病毒抗體，寶寶吃了能減輕癥狀或縮短病程。近年來，干擾素（IFN）也被用來治療輪狀病毒感染，這種葯可以抑制病毒在人體內的繁殖，從而減輕癥狀，縮短病程。