1）有血清病、支氣管哮喘、過敏性蕁麻疹及對青黴素、磺胺等一些藥物過敏者禁用。
2）低體重、早產、剖腹產等非正常出生的新生兒，暫時不宜接種乙肝疫苗。雖然疫苗接种對這部分新生兒並無害處，但因其自身的體質狀況易發生偶合事件，因此最好推遲接種時間。
3）已患有乙肝的患者及乙肝病毒攜帶者，即使接受多少支乙型肝炎疫苗，都不會產生相應的保護性抗體。