雖然幽門螺桿菌已明確列入為致癌物，但這並不意味「感染了就肯定會患癌」。一般來說，胃部的幽門螺桿菌處於正常範圍值內，對人體的影響是非常小的；但如果胃部的幽門螺桿菌超標，有可能引起以下癥狀：
▪ 反酸、燒心以及胃痛、口臭。
▪ 若幽門螺旋菌大量附在胃粘膜上，並突破胃酸、蛋白酶、不溶性與可溶性粘液層的保護作用，破壞胃部的防禦系統，會引起慢性胃炎，出現上腹部不適、隱痛，有時發生噯氣、反酸、噁心、嘔吐，一般病程緩慢，但是容易反覆發作
▪ 幽門螺旋菌破壞胃部的胃黏膜後，會導致胃黏膜、十二指腸黏膜、食道黏膜被胃酸、膽汁等物質腐蝕，引發消化性潰瘍，出現反酸、噯氣、飽脹感等上腹部不適癥狀。
▪ 幽門螺旋菌的代謝產品會直接破壞胃黏膜引起炎症反應，加上其本身具有基因毒性作用，加快胃黏膜的惡性轉化，引發胃癌。
▪ 幽門螺桿菌進入人體後，會在牙齒間隙中存活下來，促使牙斑菌大量的繁殖，併產生牙結石，引起難聞的口臭。
▪ 幽門螺旋菌若不小心跑到心臟或血管中，會引起血栓，引起生命危險。