目前HPV疫苗主要分為三種，2 價、4 價、9 價。「價」代表這款疫苗可預防的病毒種類數，價越高可預防的類型越多，同樣價格也會相對較高。另外，不同HPV疫苗的適用人群也各有差異：
二價HPV疫苗：主要針對HPV16和HPV18，能預防將近70%的宮頸癌、90%的肛門癌以及很大比例的陰道癌、外陰癌和口咽癌。
適合年齡：9~45歲女性（國內和海外）。
四價HPV疫苗：在二價HPV疫苗的保護範圍內增加HPV6和HPV11，能預防將近70%的宮頸癌、90%的肛門癌、很大比例的陰道癌、外陰癌和口咽癌，以及90%的肛門生殖器疣，
適合年齡：國內20~45歲女性，海外20~45歲女性和男性。
九價HPV疫苗：在四價HPV疫苗的保護範圍內增加HPV 31、HPV33、HPV45、HPV52 和 HPV58，預防將近90%的宮頸癌、90%的肛門癌、很大比例的陰道癌、外陰癌和口咽癌，以及90%的肛門生殖器疣。
適合年齡：國內16~26歲女性，海外16~45歲女性和男性。