親子鑒定主要是利用法醫學、生物學和遺傳學的理論和技術，從子代和親代的形態構造或生理機能方面的相似特點，分析遺傳特徵，判斷父母與子女之間是否是親生關係。
一、 原始方法
①  外貌特徵：受顯性遺傳基因影響，父子、母子、兄弟姐妹之間的長相、膚色等特徵都會有某些相似的地方，如：大耳朵、尖下巴、雙眼皮等。
②  滴骨驗親：即將生者的血液滴在死人的骨骸上，若血液能滲透入骨則斷定生者與死者有血緣關係；反之則沒有。
③  滴血驗親：將兩人血液滴於同一碗水中，如果能融在一起，那就代表二人有血緣關係；反之則沒有。
二、   現代方法
①  血型測試：通過對血型檢驗比對來確定親子關係。
②  染色體多態性：又稱異態性，是指正常人中常見的各種染色體形態的微小變異（如隨體增大、重複或缺如，着比粒區的熒光強度變異等），這種多態是可以遺傳的。
③ DNA親子鑒定：是目前最常用且最準確的親子鑒定方式，主要是通過人的血液、毛髮、唾液、口腔細胞及骨頭等，提取當中的DNA進行分析，以此判斷二人的關係。
一般來說，每個人都有23對（46條）染色體，同一對染色體同一位置上的一對基因稱為等位基因，通常一個來自父親，一個來自母親。也就是說，如果檢測到某個DNA位點的等位基因與父親或母親不相同，那就可以判定為存疑。
另外，DNA親子鑒定還可檢測兩人的親屬關係（親屬關係鑒定基因測試），在父親未能測試的情況下，可以用於鑒定祖父母與孫兒/女之間是否存在血緣關係，以及雙胞胎、兄弟姐妹、姨母/姑母、叔伯、表兄甚至外甥之間的關係。