正常情況下，如果孕婦被檢查HPV陽性，只要沒有確診宮頸癌前病變和宮頸癌，都可以正常備孕。這是因為人體感染HPV後，HPV不會進入血液系統，也不會影響胎兒發育。
不過，由於HPV的主要傳播途徑是性傳播，因此HPV有可能會感染孕婦的宮腔，導致寶寶出生時因為接觸到受污染的產道和羊水而感染HPV，儘管如此大多數感染HPV的寶寶亦會靠自身免疫力在2年內消滅病毒。
因此，若孕婦在孕期檢查發現HPV陽性，只要明確不是宮頸癌，都不需要處理，可等到產後在治療；即使確診為癌前病變，等到產後治療還是來得及的；但如果已經確診為於宮頸上皮內瘤變2～3級（CIN 2～3級）/高級別鱗狀上皮內病變（HSIL），或宮頸癌，都建議優先積極治療，待治癒後再經醫生診斷方可備孕。
至於如何判斷自己是否感染HPV或宮頸癌有否癌變？香港時代醫療集團表示，可通過TCT和HPV聯合檢查判斷，必要時需要進行陰道鏡活檢和宮頸錐切術。
另外，值得注意的是，孕婦被檢查出HPV陽性時，無論是選擇順產，還是剖腹產，寶寶出生都有機會感染HPV，只是順產導致寶寶感染HPV病毒的風險會比剖腹產大。但美國婦產科醫師協會表示，順產優點比剖腹產多，加上即使剖腹產也不能完全避免寶寶感染HPV的風險，因此孕婦沒有必要因為感染HPV病毒，而選擇剖腹產。