遺傳學研究表明，過敏性鼻炎是一種由基因與環境共同作用而引起的多因素疾病，而環境因素主要是指存在於人類生活環境的各種變應原。

香港健康體檢中心表示，過敏性鼻炎的多種表現型都受到較強的遺傳控制，目前已發現多個基因及相關轉錄因子參與本病的發病過程，包括免疫球蛋白E(IgE)相關候選基因、重要的轉錄因子、細胞因子及T細胞表面抗原等候選致病基因。

環境中的變應原可誘導特異性IgE抗體產生並與之發生髮應，這主要包括：

━ 吸入性變應原：包括真菌孢子、花粉顆粒、塵蟎、動物排泄物等，其濃度和呼吸道變應性疾病癥狀的嚴重程度明顯相關，是過敏性鼻炎的主要原因。

━ 食物變應原：食物變應原大多引起皮膚和消化道癥狀，也可以有鼻部癥狀，但是僅引起過敏性鼻炎者少見。對嬰兒來說，食物變應原主要是牛奶和大豆;而對成人而言，常見的食物變應原包括牛奶、大豆、蘋果、梨等。

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