提起胃腸道的作用，很多朋友第一反應就是「消化食物」和「吸收營養」。
胃部中的胃酸、膽汁、腸液等各種消化酶，與胃腸機械性蠕動的協同作用，可幫助我們消化食物； 而腸道則是人體主要的吸收通道，像氨基酸、蛋白質、脂肪、糖分、維生素等人體比較基礎的營養成分，以維持人體正常所需。
除此之外，作為外界與身體的交界地，胃腸道更是身體的主要屏障。胃部的強酸環境幾乎可殺死所有常見細菌（幽門螺桿菌除外）；而腸道更是我們身體中最大的免疫器官，腸的淋巴組織占身體免疫系統的70-80%。
因此，一旦胃腸道的黏膜屏障作用受到破壞，致病菌就可穿過受損的屏障，進入血液循環引起疾病發生。