乙肝疫苗的保護期限其實很長。根據國內外研究數據，完成整個乙肝疫苗接種程序後，95%以上的嬰兒、兒童和青壯年均可產生足夠的保護性抗體，保護期限至少5年以上。
但這並不表示，接種過乙肝疫苗就一定不會被傳染，原因如下：
① 乙肝抗體表面抗體的滴度會隨時間逐漸降低，當接觸乙肝病毒時仍有機會被傳染。因此，接種成功後，香港時代醫療建議每隔5年做一次乙肝檢查，若發現體內抗體滴度不足10mIU/ml，建議及時加強接種乙肝疫苗。
② 部分接種者可能因為免疫反應不夠敏感或體質問題，導致接種三針乙肝疫苗後並沒有產生足夠的保護性抗體。所以，完成乙肝疫苗接種程序後，檢查一下乙肝抗體表面抗體的滴度，若體內保護性抗體不足，建議及時進行加強注射或更改疫苗類型。
③ 一般乙肝疫苗接種程序為0-1-6，即接種第一針乙肝疫苗後一個月，需接種第二針乙肝疫苗，六個月後接種第三針乙肝疫苗。接種程序未完成，部分人有可能會因為體內保護性抗體不足而受到感染，因此必須嚴格按照接種程序接種乙肝疫苗。
④ 由於個體差異，部分人群會在接種乙肝疫苗後產生保護性抗體，但產生的抗體數量和活性可能不是十分穩定。
⑤ 近年來疫苗問題時有發生，若孩子接種了低質量疫苗，有可能會因為降低了乙肝疫苗成功率，而受到感染。
雖然乙肝疫苗接種的普及，使我國乙肝攜帶者和5歲以下兒童乙肝病毒感染率有所下降，但也不要掉以輕心，因為我們永遠都不知道病毒在哪個角落正伺機傷害我們和孩子的身體。
因此及時接種疫苗，並定期進行乙肝檢查，仍然是降低乙肝病毒威脅的最佳手段。